В Ельниковском краеведческом музее функционируют 12 постоянных экспозиций: археологическая, бытовая, ремесленная, этнографическая, 1-й Мировой войны, установление советской власти и репрессии 1930-х гг., развитие просвещения в Ельниковском крае в начале ХХ века, экспозиция Великой Отечественной войны (самая обширная по площади и содержанию), история образования Ельниковского района, история районных учреждений культуры и знаменитые деятели культуры, история здравоохранения района, история сельхозпредприятий и промышленности Ельниковского района.
Все постоянные экспозиции оформлены по тематическому методу, они подчинены единому замыслу – познакомить посетителя с историей Ельниковского района. Каждая из экспозиций включает в себя текстовый информационный материал по определенной теме, который дополнен музейными предметами, назначение которых состоит в более глубоком раскрытии содержания замысла экспозиции. Вместе с визуальными предметами в музее используются и аудиоэкспонаты: патефон, радиолы и приемники, аудиозаписи воспоминаний. Они используются непосредственно в ходе экскурсионного процесса для более глубокого погружения экскурсантов в определенное событие или эпоху.